標(biāo)本保藏研究中國(guó)東北地區(qū)是全球同緯度物種多樣性最豐富的區(qū)域之一，包括全國(guó)八個(gè)植被區(qū)域中的四個(gè)植被區(qū)域，因此，中國(guó)東北生物物種十分豐富、復(fù)雜，在全國(guó)占有十分重要的位置。
維管束植物：
建館初期對(duì)東北地區(qū)進(jìn)行了全面的植物調(diào)查和標(biāo)本采集，出版《東北木本植物圖志》、《東北草本植物志》12卷、《東北植物檢索表》等；90年代后開(kāi)展植物資源的縣域調(diào)查和區(qū)系研究工作，物種分布細(xì)化到東北地區(qū)每個(gè)縣域，為我國(guó)植物資源研究做出重要貢獻(xiàn)。目前共保藏維管束植物標(biāo)本33萬(wàn)份，近3100種，包括368個(gè)新物種，模式標(biāo)本415份，標(biāo)本種類(lèi)達(dá)東北地區(qū)已知植物總數(shù)的95%，占全國(guó)植物種數(shù)的10%以上。
苔蘚：
苔蘚植物標(biāo)本館建立于1957年，研究范圍涵蓋全國(guó)34個(gè)省區(qū)和直轄市（包括港、澳、臺(tái)）以及國(guó)外歐、亞、北美、澳等13個(gè)國(guó)家。60余年來(lái)，收藏有苔蘚植物標(biāo)本（基因庫(kù)）15萬(wàn)余份，積累資料4千余篇（冊(cè)），與國(guó)外30余個(gè)重要的苔蘚植物研究機(jī)構(gòu)建立友好的合作研究關(guān)系；完成出版了25部專(zhuān)著，近200篇論文；發(fā)現(xiàn)中國(guó)新記錄3科30屬531種，建立了2新亞目2新科3新屬和115新種；首次發(fā)現(xiàn)了蘚類(lèi)植物傳孢（粉）器官在長(zhǎng)期生態(tài)環(huán)境過(guò)程中形成的主要形式和相應(yīng)結(jié)構(gòu)，有力地證明苔蘚植物起源于綠藻及其內(nèi)在演化過(guò)程，并提出了以科為單位的新演化系統(tǒng)；以苔類(lèi)雌苞組成結(jié)構(gòu)為基礎(chǔ)，提出了世界苔類(lèi)新修正演化系統(tǒng)。
昆蟲(chóng)：
我館昆蟲(chóng)方向的特色研究是水生鞘翅目的分類(lèi)與生物多樣性研究。昆蟲(chóng)標(biāo)本館主要保存采集自全國(guó)各地的水生鞘翅標(biāo)本、采集自東北三省的林業(yè)昆蟲(chóng)標(biāo)本及植物病蟲(chóng)害標(biāo)本，標(biāo)本總量7.3萬(wàn)余號(hào)。1993年開(kāi)始，東北生物標(biāo)本館與奧地利維也納自然歷史博物館合作，用10年時(shí)間，對(duì)于中國(guó)二十余省市、自治區(qū)、直轄市的水生鞘翅目昆蟲(chóng)進(jìn)行了系統(tǒng)的調(diào)查研究，出版英文著作《Water Beetles of China》一書(shū)三卷，專(zhuān)著中報(bào)告1個(gè)新科、8個(gè)新屬、200多個(gè)新種，是研究水生昆蟲(chóng)分類(lèi)的必備參考書(shū)。近10年間，水生鞘翅目方向研究人員發(fā)現(xiàn)并報(bào)告了水生鞘翅目2個(gè)新記錄屬、32個(gè)新種；目前水生鞘翅目昆蟲(chóng)標(biāo)本的存儲(chǔ)數(shù)量及模式標(biāo)本的種類(lèi)在我國(guó)同類(lèi)標(biāo)本館中處于領(lǐng)先地位，為我國(guó)水生鞘翅目物種研究奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。
真菌：
真菌研究始于1956年，主要開(kāi)展東北地區(qū)傘菌、多孔菌、銹菌等類(lèi)群的研究。2000年后，重點(diǎn)開(kāi)展木材腐朽菌的分類(lèi)和系統(tǒng)學(xué)研究，目前共發(fā)現(xiàn)真菌新科1個(gè)，新屬20個(gè)，新種279個(gè)，新組合種66個(gè)，新記錄科、屬、種400余個(gè)，使中國(guó)木生真菌種類(lèi)由800種增加到1500多種，占全球的60%左右。標(biāo)本館保藏國(guó)內(nèi)外真菌標(biāo)本3萬(wàn)余份，菌株1000余株，涵蓋我國(guó)所有森林類(lèi)型中木生真菌種類(lèi)，包括大量的靈芝、木耳、桑黃等具有重要經(jīng)濟(jì)價(jià)值的種類(lèi)標(biāo)本和菌株。
